探針法熒光定量PCR試劑盒通用原則：
1，先選擇好探針，然后設計引物使其盡可能的靠近于探針。
2， 擴增子的長度應不超過400bp，理想的能在100－150bp內，擴增片斷約短，有效的擴增反應就越容易獲得。較短的擴增片斷也容易保證分析的一致性
3， 保持GC含量在20％和80％之間，GC富含區容易產生非特異反應，從而會導致擴增效率的降低，及在SG分析中非特異信號。
4， 為了保證效率和重復性，應避免重復的核苷酸序列，尤其是G（不能有4個連續的G）
5， 將引物和探針互相進行配對檢測，以避免二聚體和發卡結構的形成。
探針法熒光定量PCR試劑盒探針設計指導
1，在設計引物之前設計探針
2，探針的Tm值應在68－70℃之間，如果是目測探針，則要仔細審查GC富含區。
3，探針的5’端要避免有鳥氨酸，5’G會有淬滅作用，即使被切割下來這種淬滅作用也還會存在
4，選擇C多于G的鏈作探針，G的含量多于C會降低反應效率，這時就應選擇配對的另一條鏈作為探針。
6， 探針應盡可能的短，不要超過30個bp。
7， 檢測探針的DNA折疊和二級結構。