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    PCR反應DNA 復制過程解讀
    點擊次數:499 更新時間:2025-01-21

           PCR全稱多聚酶鏈式反應(polymerase chain reaction),是一種非常強大的技術,可以通過一種非常簡單但是高效的方法來復制DNA,它可看作是生物體外的特殊DNA復制,PCR的最大特點是能將微量的DNA大幅增加。
    復制DNA必要性:
    DNA復制是很多研究的基礎,例如,當我們對RNA進行測序時,必須先將RNA轉化為DNA,并進行大量復制。在對于某個人進行基因組測序時,我們不能對于某個細胞或者單個分子進行測序。測序的基礎要求擁有大量的相同的DNA分子拷貝,因此,DNA復制是做生物研究中的基礎工具。那么怎么獲取這么多拷貝呢?PCR正是一個復印機一般的存在,利用DNA的幾個特性,成為批量復制DNA的方法。

    PCR原理及步驟:
    說到原理,我們就要回顧一下DNA結構:

    DNA分子兩條單鏈以雙螺旋結構結成,DNA兩條鏈擁有自行粘附的特性,A與T配對,C與G配對,DNA粘附特性是PCR的核心原理。同時DNA復制時也是具有方向性的,DNA序列的開始端稱為5‘端,末端稱為3’端。
    在復制時,需要加入一種叫做引物(primers)的東西??梢詫⒁锢斫鉃橐粋€短序列,下圖中紅色的部分就是引物。引物通常15到20個堿基,可以短一些,也可以長一些。但是必須和我們想合成的DNA片段成互補關系。將引物與DNA鏈混合時,會自動粘在上面,因為他們是互補的。引物獲得可以從公司訂購,后續有機會我們也會分享引物設計方法。

    PCR過程分三步:
    變性--退火--延伸,PCR中會對這三步循環播放。
    A. 變性

    在開始準備變性的過程中,要慢慢加熱混合物,加熱混合物時,兩條鏈間氫鍵會融化,DNA兩股鏈會分開,就像上圖粉色的部分。如果混合物熱的情況下,引物不會和DNA黏在一起,兩條DNA鏈也不會黏在一起。
    B. 退火
    接下來混合物慢慢的冷卻,這時引物會黏在DNA上,因為引物較小,更容易漂浮起來,和DNA結合。溫度控制在54攝氏度左右可以保證引物序列和DNA互補配對,而DNA雙鏈不會黏在一起。
    C. 延伸
    這一步我們需要一個幫助DNA復制的工具,即聚合酶鏈式反應中的聚合酶(polymerase)。下圖中綠色的圖形就代表著DNA聚合酶,所到之處萬物生,這也是我們身體各個細胞中用來復制DNA的工具。聚合酶的作用方式也非常生猛,直接找到部分單鏈,部分雙鏈的地方,咬住那里的序列開始進行復制。也就是說聚合酶會先找到引物,開始沿著引物進行缺失的序列填充。如下圖中看到的,在一輪填充序列后,引物所在的鏈條(橙色鏈)會被補齊。這一步中會加入As, Cs, Gs和Ts這些DNA原材料,這樣可以把他們整合到新的與模板DNA 鏈互補的半保留復制鏈。這一步的溫度稍微高一些,大概是72攝氏度。最初我們加入的是雙鏈DNA,在一個周期后,我們會獲得四條鏈,兩個周期后獲得8條鏈,30個周期后,會獲得10億條DNA鏈。

    DNA 復制所需的基本要素:
           DNA 的半保留復制是生物進化和傳代的重要途徑。雙鏈 DNA 在多種酶的作用下可以變性解旋成單鏈,在 DNA 聚合酶的參與下,根據堿基互補配對原則復制成同樣的兩分子拷貝。在實驗中發現,DNA 在高溫時也可以發生變性解鏈,當溫度降低后又可以復性成為雙鏈。因此,通過溫度變化控制 DNA 的變性和復性,加入設計引物,DNA 聚合酶,dNTP 就可以完成特定基因的體外復制,這是 PCR 的理論基礎。PCR 反應是在體外模擬 DNA 的復制過程,因此反應體系中必須具有 DNA 復制所需的基本要素:
    1、模板(template),含有需要擴增的 DNA 片段。
    2、引物(primer),一對引物決定了需要擴增的起始和終止位置。
    3、聚合酶(polymerase ),DNA 聚合酶復制需要擴增的區域。
    4、脫氧核苷三磷酸(dNTP),用于構造新的互補鏈。
    5、緩沖液(buffer),提供適合聚合酶行使功能的化學環境。


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